Hanasaki Tsubomi é uma garota no 2º ano do ginásio (8ª série) que ama flores e plantas. Um dia ela começou a ter um estranho sonho. Neste sonho uma grande árvore florida aparece. De repente essa árvore perde todas as suas flores e fadas aparecem. Poucos dias depois que Tsubomi foi transferida para o Ginásio Meidou, as fadas vistas em seus sonhos aparecem diante dela e pedem para que ela se torne a lendária guerreira Pretty Cure e proteja a Árvore dos Coração. Entretanto, Tsubomi acha que ela não...