No ano de 2005, uma raça de monstros alienígenas chamados Zonders emergem do subsolo e lançam uma série de ataques à cidade de Tóquio. A única defesa contra essas criaturas é a agência secreta conhecida como Gutsy Geoid Guard (ou 3G) e sua melhor arma, o incrível robô gigante GaoGaiGar. O piloto de GaoGaiGar, Guy Shishio, é um ex-astronauta que quase foi morto dois anos antes quando os Zonders caíram pela primeira vez na Terra. A vida de Guy foi poupada quando um misterioso leão robô chamado Gal...