A série segue as aventuras de uma equipe de cientistas no Calico, um navio de pesquisa hidrofólio, liderado pelo Capitão Carl Majors. O resto da equipe inclui o cientista Dr. Quinn Darien, seu sobrinho Pete Darien e seu assistente de pesquisa Brock. Também para o passeio está Godzuki, o "sobrinho covarde" de Godzilla e melhor amigo de Pete, que tem um papel alegre no desenho. Godzuki pode tentar voar usando as pequenas asas sob seus braços. Sempre que Godzilla tenta respirar fogo, ele normalment...