Super Campeões J contém 47 episódios, divididos em duas fases. De 1 a 33, conhecemos a história de Oliver Tsubasa, mais um episódio que é um resumo contando de quando Oliver enfrenta Benji até o dia de quando Nankatsu venceu Meiwa, contado por Ryo Ichizaki. De 35 a 47, a revelação de um novo personagem: Shingo Aoi. Além disso, esta fase também transmite o fim de São Paulo x Flamengo, a introdução de Shingo Aoi na série A, o surgimento dos Sete Verdadeiros, e as Eliminatórias para a Copa da Ásia ...