O ano é 2225AC. Kouji Aiba e Aoi Housen estão servindo como astronautas em treinamento no Liebe Delta que está localizado na costa do Mar Geduld. Quando sabotadores com interesses desconhecidos os atacam de repente durante um procedimento padrão de mergulho, a estação espacial afunda no mar de Geduld, um campo de plasma que conecta todos os planetas como um sistema nervoso e destrói qualquer espaçonave que se aproxime demais. Com todos os adultos abordo mortos, os jovens astronautas vão ter de s...